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作者：李佳丹扬;马晨峰;黄建辉;邵博;吴培福;
单位：西南林业大学生物与食品工程学院;陕州区第一人民医院;
摘要：试验采用高通量宏基因组测序技术，旨在探究云南省宁蒗高原鸡在林下散养与笼养模式下肠道菌群结构及耐药基因（ARGs）的差异性。试验选取30～40周龄的健康宁蒗高原鸡，分别来自林下散养和笼养两种饲养模式，通过比较分析其肠道微生物群落。结果表明：林下散养模式显著增加了肠道微生物的多样性(P<0.05)，其中厚壁菌门（Firmicutes）和变形菌门（Proteobacteria）为两模式下的优势菌门，但在林下散养组中厚壁菌门（41.63%VS 39.88%）和变形菌门（41.09%VS 29.96%）的相对丰度占比高于笼养组。林下散养组中莫拉氏菌科（Moraxellaceae）、梭菌科（Clostridiaceae）、不动杆菌属（Acinetobacter）和梭菌属（Clostridium）的相对丰度较笼养组显著提高(P<0.05)；在耐药基因分析中，林下散养组展现出更丰富的ARGs种类，尤其是四环素类和多重耐药类，而笼养组则以大环内酯类、林可酰胺类和链阳菌素类ARGs为主。进一步分析发现，尽管林下散养组ARGs种类较多，但笼养组在ARGs的物种丰富度、分布均匀度及综合多样性指数上表现更高。此外，还识别出鲍曼不动杆菌和拟杆菌属An322种在耐药传播中的潜在的关键作用。研究表明饲养模式对肠道微生物组成及ARGs分布有影响，为制定减少抗生素耐药性传播风险的饲养管理策略提供了科学依据。
关键词：饲养模式;;宏基因组测序;;宁蒗高原鸡;;肠道微生物多样性;;耐药基因
基金资助：云南省教育厅项目[111723117]
