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中国畜牧杂志2025年第07期:威宁牛和思南牛Y染色体基因组遗传多样性与父系起源研究

来源:期刊VIP网 时间:


作者:吴道义;王楠;阎卉萱;王明进;曾继晶;李付强;雷初朝;马金萍;

单位:毕节市农业科学院;西北农林科技大学动物科技学院;湖南天华实业有限公司;

摘要:本研究旨在从基因组水平探究威宁牛和思南牛的遗传多样性及父系起源,为威宁牛和思南牛的父系种质资源保护与利用提供科学依据。利用全基因组重测序方法和生物信息学方法对20头威宁牛和13头思南牛的Y染色体基因组进行SNP扫描分析,使用已发表的5头黄牛Y染色体基因组作为单倍型对照组,构建Y染色体单倍型NJ树及单倍型网络图。结果表明,20头威宁牛共定义12种Y染色体单倍型,其Y染色体单倍型多样性为0.947±0.034,核苷酸多样性为0.302±0.042,而13头思南牛共确定8种Y染色体单倍型,其Y染色体单倍型多样性为0.936±0.042,核苷酸多样性为0.187±0.082,表明威宁牛的父系遗传多样性明显高于思南牛。NJ树和单倍型网络图表明,20头威宁牛具有Y1(10%)、Y2(25%)和Y3(65%)3种Y染色体单倍型组,Y3单倍型组包括Y3a(45%)和Y3b(20%)2种亚单倍型组,其中Y3a亚单倍型组占优势地位。思南牛具有Y1(15.4%)和Y3(84.6%)2种Y染色体单倍型组,以Y3单倍型组中的Y3a(53.8%)为主要亚单倍型组。在威宁牛和思南牛中均检测到Y1、Y3a和Y3b等3种单倍型组,都以瘤牛血统为主;威宁牛和思南牛的Y染色体遗传多样性丰富。

关键词:威宁牛;;思南牛;;Y染色体基因组;;单倍型;;父系起源

基金资助:贵州省高层次创新型人才“千层次”项目毕科人才合[2024]5号;; 财政部和农业农村部:国家肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37)