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作者：梁鱼;于金宇;许钟镐;王婉宁;
单位：吉林大学第一医院肾病内科;吉林大学第一医院泌尿外科;
摘要：目的：评估FBJ鼠科骨肉瘤病毒癌基因同源物B(FOSB)基因在免疫球蛋白A肾病（IgAN）和常见慢性肾脏病（CKD）中的表达特征，探讨其作为潜在关键候选基因或生物标志物的价值。方法：从基因表达综合数据库（GEO）中下载IgAN、糖尿病肾病（DKD）、膜性肾病（MN）和微小病变肾病（MCD）肾小球样本的RNA测序数据集。采用最小绝对收缩和选择算子（LASSO）回归、随机森林（RF）和支持向量机（SVM）机器学习方法筛选相应CKD的特征基因。对IgAN的特征基因进行基因本体论（GO）功能富集和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。采用pROC包绘制受试者工作特征（ROC）曲线评估特征基因对IgAN的诊断效能，并筛选诊断效能最高的基因进行基因集富集分析（GSEA），分析其与IgAN核心免疫细胞浸润的相关性。基于Nephroseq v5平台分析肾组织中FOSB表达水平与肾功能的关系。收集IgAN、DKD、MN和MCD患者肾脏组织标本各5例及5例癌旁正常肾组织标本（对照组），采用免疫组织化学染色法检测各组肾组织中FOSB蛋白表达水平。结果：共筛选出110个IgAN肾小球差异表达基因（DEGs），其中FOSB、NR4A2和DUSP1为特征基因。IgAN组FOSB mRNA表达水平明显低于健康对照组（P<0.05）。GO功能富集分析，IgAN特征基因主要富集于多巴胺生物合成、中脑多巴胺能神经元分化、肽基丝氨酸/苏氨酸去磷酸化及对皮质酮的反应等生物过程。KEGG信号通路富集分析，IgAN特征基因主要富集于可卡因成瘾、安非他命成瘾、白细胞介素17(IL-17)信号通路、醛固酮合成与分泌和5-羟色胺能突触等信号通路。ROC曲线分析，FOSB对IgAN具有良好的诊断效能。GSEA分析，FOSB高表达组中，DEGs在精氨酸和脯氨酸代谢、丁酸代谢、成红细胞白血病病毒癌基因同源物（ERBB）信号通路、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路和果糖及甘露糖代谢等通路显著富集；FOSB低表达组中，DEGs在同种异体移植排斥反应、细胞外基质受体相互作用和1型糖尿病等通路显著富集。免疫细胞浸润分析，自然杀伤细胞、中性粒细胞和M1型巨噬细胞是IgAN的核心免疫细胞，且FOSB表达与中性粒细胞浸润呈正相关关系（r=0.42, P<0.05）。免疫组织化学检测，与对照组比较，IgAN、DKD、MN和MCD组患者肾小球组织中FOSB蛋白表达水平均明显降低（P<0.05）。结论：FOSB基因在IgAN、DKD、MN和MCD患者肾小球组织中呈低表达，其可能是IgAN潜在的生物标志物。
关键词：FBJ鼠科骨肉瘤病毒癌基因同源物B;;免疫球蛋白A肾病;;生物信息学;;免疫组织化学;;慢性肾脏病;;候选基因
基金资助：国家自然科学基金项目（82000688）;; 吉林省科技厅自然科学基金项目（20210101339JC）
