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吉林大学学报(医学版)2025年第05期:LAMP联合CRISPR/Cas12a系统检测副溶血性弧菌tlh基因方法的建立及其评价

来源:期刊VIP网 时间:


作者:周钰娇;杨继飞;刘岩;丁文博;张先宇;杨建宇;高林然;赵云冬;孙丽媛;

单位:北华大学医学技术学院临床病原学检验教研室;

摘要:目的:建立环介导等温扩增(LAMP)和簇状规则间隔短回文重复序列(CRISPR)/CRISPR相关蛋白12a(Cas12a)(CRISPR/Cas12a)系统相结合的病原微生物快速检测方法,并评价其检测副溶血性弧菌(Vp)不耐热溶血毒素(tlh)基因的效果。方法:以Vp的tlh基因作为靶基因,设计LAMP引物和CRISPR RNA(crRNA),构建并优化LAMP-CRISPR检测体系各成分最佳浓度配比,以蜡样芽孢杆菌、金黄色葡萄球菌及大肠埃希菌为对照组,建立快速检测Vp tlh基因的LAMPCRISPR/Cas12a方法,并对该方法的特异性、灵敏度、重复性和阳性符合率进行评价。结果:该方法能特异性检出Vp,蜡样芽孢杆菌、金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌均为阴性结果。Vp DNA提取浓度为190.67 mg·L~(-1)时吸光度(A)(260)/A(280)比值为1.84。在定量PCR(qPCR)仪37℃、80个循环、40 min反应条件下,LAMP-CRISPR/Cas12a体系中Cas12a蛋白和crRNA的浓度为50 nmol·L~(-1)时肉眼亮度及相对荧光强度峰高,检测Vp DNA浓度灵敏度可达10~(-6) mg·L~(-1);重复性试验表明,不同实验人员在不同实验环境、不同时间重复检测结果一致。结论:建立的LAMP-CRISPR/Cas12a方法可以快速检测Vp的tlh基因,其灵敏度高、特异度强,可实现现场短时间的可视化检测。

关键词:副溶血性弧菌;;CRISPR-Cas12a系统;;tlh基因;;环介导等温扩增;;核酸检测

基金资助:吉林省科技厅科技发展计划项目(20230204085YY,20230202059NC);; 北华大学研究生创新计划项目([2023]071)