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作者:潘晓荷;潘人祎;李淑妃;陆琦;徐雪琴;刘志武;
单位:温州市中心医院检验科;金华市妇幼保健院超声科;温州市中心医院神经内科;甘肃省兰州市兰州大学第一医院医学检验中心;
摘要:目的 探讨宏基因组二代测序(mNGS)对中枢神经系统(CNS)感染病原学诊断效能。方法 连续纳入温州市中心医院2022年6月-2025年1月间收治、怀疑有中枢神经系统(CNS)感染的73例住院患者,采集脑脊液同时做mNGS及传统培养,以CNS感染临床诊断为依据,比较两种方法的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值及Youden指数,采用受试者工作特征(ROC)曲线比较mNGS、传统培养的诊断效能。结果 最终临床确诊CNS感染患者41例,mNGS(DNA)检出阳性36例,包括单纯细菌感染且种类仅为1种的11例,单纯病毒(DNA)感染且种类仅为1种的4例,2种及以上病原体混合感染21例,混合感染模式及例数分别为:单纯细菌感染种类2种及以上4例、单纯病毒(DNA)感染种类2种及以上6例、细菌及病毒(DNA)混合感染4例、细菌及真菌混合感染1例、病毒(DNA)及真菌混合感染5例、细菌病毒(DNA)真菌混合感染1例;传统培养检出阳性8例,包含细菌感染6例、真菌感染2例。mNGS的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、约登指数分别为0.878、0.719、0.800、0.821、0.597;传统培养的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、约登指数分别为0.195、0.969、0.888、0.484、0.164。mNGS的阳性率高于传统培养(χ~2=29.000,P<0.001),阳性检出率高于传统培养(χ~2=4.690,P=0.030)。ROC曲线显示mNGS诊断CNS感染的曲线下面积(AUC)为0.790,传统培养则为0.573。结论 脑脊液mNGS可有效提升CNS感染病原体检出,诊断效能优于传统培养,可作为传统诊断技术的必要补充。
关键词:中枢神经系统感染;;病原学诊断;;宏基因组二代测序;;脑脊液培养;;精准诊断
基金资助:浙江省温州市科技局项目(Y20220740);; 温州市精准医疗检测重点实验室(2021HZSY0065)