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作者：李建棣;黄婉英;陈罡;詹彦婷;
单位：广西医科大学第一附属医院病理科;
摘要：目的 利用染色质免疫共沉淀测序技术探究CCCTC结合因子(CTCF)在老年肝细胞癌中的临床价值及潜在促癌机制。方法 基于全球最大的肝细胞癌高通量测序数据集癌症基因组图谱-肝细胞癌(TCGA-LIHC),分析CTCF mRNA在371例肝细胞癌及其癌旁组织中的相对表达，并通过免疫组织化学染色分析验证其蛋白表达。利用Kaplan-Meier生存分析、肿瘤免疫评估资源(TIMER)反卷积运算评估CTCF对肝细胞癌患者预后及免疫微环境的影响。通过结合差异表达分析、CTCF共表达分析及染色质免疫共沉淀测序分析，鉴定CTCF候选靶基因并预测其分子功能。通过单细胞测序分析鉴定肝细胞癌细胞类型，验证CTCF及其调控靶基因的表达分布。最后利用药敏性分析及分子对接技术预测CTCF相关治疗药物。结果 CTCF mRNA及蛋白质在肝细胞癌组织显著过表达，提示肝细胞癌患者预后较差(HR=1.9,P=0.009 5)。CTCF表达水平与肝细胞癌免疫微环境中的中性粒细胞、树突细胞、巨噬细胞、CD4~+ T细胞、B细胞及CD8~+T细胞浸润丰度呈显著正相关(P<0.05)。CTCF共表达转录靶点主要富集于mRNA代谢、基因表达表观调控、细胞周期等一系列代谢、增殖、调控相关途径。CTCF转录因子在DEXH-box解旋酶(DHX)9的基因启动子区域存在特定结合峰(chr1:182838347～182839347)。单细胞测序分析结果证实，CTCF/DHX9在恶性细胞中表达。CTCF与双十一胺二环磷酸(CNDAC)药物的最小半抑制浓度呈正相关，两者具有较高亲和力(Vina评分=-5.6)。结论 CTCF/DHX9调控轴可能协同促进了肝细胞癌的进展。
关键词：肝细胞癌;;CCCTC结合因子(CTCF);;转录调控机制;;分子功能;;单细胞测序;;分子对接
基金资助：广西壮族自治区卫生和计划生育委员会自筹经费科研课题(Z-A20220469)
