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河南工业大学学报(自然科学版)2025年第06期:扩展青霉生物钟基因的生物信息学与表达分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:任佳宁;陈书瑶;张芳;

单位:中国海洋大学食品科学与工程学院;

摘要:生物钟在调节真菌生长表型、代谢节律及同步环境变化等方面具有重要作用。通过形态学观察不同光处理下扩展青霉(Penicillium expansum)菌落形态,利用生物信息学方法对生物钟蛋白的理化性质、多序列比对、系统进化树、保守结构域、二/三级结构、磷酸化位点及蛋白互作等进行预测分析,采用qPCR技术探究基因表达特性。结果表明:昼夜蓝光照射诱导P.expansum呈同心菌丝环节律表型;生信学手段获得该菌生物钟核心组件基因,命名PeWC-1、PeWC-2和PeFRH,编码3种蛋白均为无跨膜结构、酸性不稳定的亲水蛋白,等电点介于5.58~7.03,分子质量分别为97.15、43.65和128.71 kDa,具有与模式菌粗糙脉胞菌相同数量和类型的功能结构域,二级结构主要含α-螺旋、无规则卷曲,磷酸化位点丰富,与各类代谢途径蛋白互作密切。3个基因在一个光周期内均呈现节律性表达,预示P.expansum存在生物钟调控的分子机制。本研究将为进一步利用反向遗传学手段深入研究生物钟在真菌中的生物学功能奠定基础。

关键词:扩展青霉;;生物钟;;昼夜节律;;生物信息学分析;;基因表达

基金资助:国家自然科学基金项目(32172275)