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作者：邸琨;谢小华;赵田华;吴巧娜;王宇佳;苏彦雷;孙殿兴;岑山;
单位：石家庄市第三医院;河北省人民医院;联勤保障部队第九八〇医院;中国医学科学院,北京协和医学院医药生物技术研究所;
摘要：目的 探索根皮素对新型冠状病毒RNA聚合酶的抑制活性，并预测3种根皮素类似物小分子的靶酶抑制活性。方法 运用分子对接手段研究根皮素与RNA聚合酶活性位点处的结合模式；利用细胞水平的新型冠状病毒RNA聚合酶nsp7/nsp8/nsp12催化反应体系检测根皮素对RNA聚合酶的抑制活性。选择3种与根皮素结构类似的中药小分子进行靶酶抑制活性预测，应用分子对接方法研究它们与靶酶活性位点间的结合模式。结果 根皮素及其类似物均可较好地结合于RNA聚合酶的活性位点处，占据NTPs通道而阻碍核苷酸底物的进入，进而抑制RNA聚合酶主导的核酸复制。细胞水平上的抑制RNA聚合酶活性测试实验结果表明，根皮素对新型冠状病毒RNA聚合酶具有明显的抑制活性，虽然活性弱于瑞德西韦，但其细胞毒性亦低于瑞德西韦；同时，预测根皮素类似物亦可抑制RNA聚合酶而具有抗新型冠状病毒药理作用。结论 研究证实根皮素具有RNA聚合酶抑制活性，并预测根皮素类似物小分子亦具有RNA聚合酶抑制活性，结果可进一步为抗新型冠状病毒药物研发提供参考。
关键词：新型冠状病毒;;RNA聚合酶;;根皮素;;类似物;;分子对接;;活性测试
基金资助：国家自然科学基金项目(81672041);; 河北省卫生健康委重点科研攻关计划项目(20231303)
