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作者：王莉娟;曹伟;王小强;杨舒慧;李强;
单位：四川省畜牧总站;
摘要：为分析川南黑山羊保种群的遗传结构，本研究使用山羊65K SNP芯片对289只川南黑山羊（40只公羊和249只母羊）进行了单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP）测定，通过Plink(V1.90)、GCTA(V1.94)、MegaX(V10.0)和R软件对川南黑山羊保种群体的遗传结构及近交程度进行分析。结果表明，289只川南黑山羊保种群体的多态标记比例（Proportion of Polymorphic Marker,P_N）为87.6%；有效群体含量（Effective Population Content,Ne）、多态信息含量（Polymorphism Information Content,PIC）、最小等位基因频率（Minor Allele Frequency,MAF）分别为22.5、0.285、0.261；观察杂合度（Observed Heterozygosity,Ho）、期望杂合度（ExpectedHeterozygosity,He）分别为0.363、0.366；群体平均遗传距离为0.291，基于ROH的平均近交系数为0.036，保种群所有公羊可划分为17个家系，满足保种场的血缘数量要求。综上所述，川南黑山羊保种群体总体上近交水平较低，近交衰退风险低，但群体多态性偏低，需引入纯种血缘，扩大保种群体核心群。
关键词：川南黑山羊;SNP芯片;保种效果;遗传多样性;遗传结构
基金资助：四川省“天府青城计划”天府农业大师项目（川青城第944号）; 现代农业产业技术体系四川肉羊创新团队（SCC XTD-2024-14）
