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作者：马建飞;徐均钊;胡宗福;吴白乙拉;吴江鸿;包呼格吉乐图;白德日根;牛化欣;
单位：内蒙古民族大学动物科技学院;内蒙古自治区农牧业技术推广中心;内蒙古自治区乌拉盖管理区农牧技术推广中心;
摘要：试验旨在系统解析地域特色的蒙古牛瘤胃微生物结构、功能及其耐粗饲生物特性。选取冬季放牧的3～4岁、体重约460kg的蒙古牛6头，经口采集瘤胃液样品，利用Nova-seq宏基因组测序技术分析蒙古牛瘤胃微生物群落结构及功能基因组成。结果显示：共获得525 067 826条有效序列，构建非冗余基因集后共获得8022168个基因；物种注释结果表明细菌占比丰度为95.25%，其余属于古菌、真菌、纤毛虫和病毒。蒙古牛瘤胃优势菌群依次为拟杆菌门（Bacteroidota）、厚壁菌门（Firmicutes）和广古菌门（Euryarchaeota）；在属水平上相对丰度依次为拟杆菌属（Bacteroides）、普雷沃氏菌属（Prevotella）和梭菌属（Clostridium）等；在碳水化合物活性酶（CAZy）水平功能分析中，蒙古牛瘤胃微生物基因主要集中在糖苷水解酶（GH）中，其中GH2、GH3、GH31、GH51、GH97家族的基因丰度占比较高，且寡糖降解酶的基因数量最多；蒙古牛瘤胃微生物种与CAZy关联分析显示，GH家族是纤维素降解酶的主要来源，所注释的微生物主要有普雷沃氏菌（29.39%）、拟杆菌（26.69%）、梭菌（7.65%）和颤螺菌（2.21%）等；在KEGG分析中，碳水化合物代谢和氨基酸代谢通路的丰度最高。可见，蒙古牛瘤胃富含纤维素降解菌、相关酶类功能基因及代谢通路。
关键词：瘤胃微生物;宏基因组;功能;纤维素降解酶;蒙古牛
基金资助：内蒙古自然科学基金面上项目（2022MS03074）; 内蒙古自治区教育厅基本业务费（GXKY22041）; 内蒙古自治区高等学校青年科技英才支持计划（NJYT22054）; 内蒙古自治区科技攻关项目（2020GG0108、2021GG0008、2021GG0035）
