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作者:余展鹏;张溱乐;张艳玲;关艺琳;陈闻灏;彭亮;
单位:广州医科大学附属第五医院医学检验科;广州医科大学金域检验学院;广州医科大学第一临床学院;
摘要:目的 比较基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)与脉冲场凝胶电泳(PFGE)在铜绿假单胞菌分型与传播链分析中的应用。方法 本研究收集广州医科大学附属第五医院ICU分离的16株铜绿假单胞菌,对其进行药物敏感性试验,采用PFGE进行分型,并利用MALDI-TOF MS进行蛋白质谱分析。质谱数据分别通过MALDI Biotyper和Mass-Up进行处理,并计算辛普森多样性指数(SDI)、调整兰德指数(ARI)和华莱士系数(AW),以评估MALDI-TOF MS与PFGE结果的一致性。此外,基于PFGE分型结合菌株的ICU床位分布及采样时间,评估ICU内该菌的潜在传播模式。结果 PFGE将16株铜绿假单胞菌划分为12型,而MALDI Biotyper和Mass-Up处理的质谱数据分别分为10型和11型。SDI计算结果显示,MALDI Biotyper和Mass-Up处理的数据多样性较低(SDI值分别为0.925和0.875),均未达到PFGE(0.975)的分辨水平。ARI_((MALDI Biotyper VS PFGE))值为0.134,而ARI_((Mass-Up VS PFGE))值仅为0.072,二者与PFGE的一致性均较低,分型结果与PFGE差异较大。在分型推导能力方面,AW_((MALDI Biotyper→PFGE))值为0.088,优于Mass-Up,但仍难以复现PFGE的分型模式。结论 MALDI-TOF MS的分型能力低于PFGE,且在菌株传播链的复现方面存在局限。经MALDI Biotyper处理的数据能提供有限参考,但经Mass-Up处理的数据稳定性不足。
关键词:铜绿假单胞菌;;基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱;;脉冲场凝胶电泳;;同源性分析;;传播链分析;;医院获得性感染
基金资助:广东省基础与应用基础研究基金自然科学基金(2021A1515011081)