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作者:刘艳;唐凯临;吕爱平;王海芸;
单位:同济大学生命科学与技术学院;
摘要:采用AI模型AlphaFold与传统同源建模(SWISS-MODEL)方法对孤儿蛋白质GPR158结构进行预测,通过对比2种方法的预测结果,明确不同方法的适用场景及其限制,并理解模型评估指标的内在联系。结果显示,AlphaFold3预测的模型质量最优,不仅成功重现了跨膜区的特征,还精准地预测出该受体特有的细胞外Cache结构域,使其成为探索GPR158潜在配体结合特性的更优选择。本实验有助于推动AI模型在蛋白质结构预测中的应用,从而促进药物设计、蛋白质设计等领域的研究。
关键词:人工智能;;同源建模;;蛋白质结构预测;;对比实验;;模型评估
基金资助:2023年度上海高校市级重点课程建设项目(2000104119)