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作者：靳丽娜;郑惠玲;
单位：西北农林科技大学动物科技学院;
摘要：本研究通过加权基因共表达网络分析（Weighted Gene Co-expression Network Analysis,WGCNA）筛选奶山羊（Capra hircus）不同生理阶段乳腺发育的关键基因。采用GEO数据库中的GSE185981和GSE97089数据集，包括妊娠晚期（LG）、泌乳高峰期（PL）、泌乳后期（LL）和干奶期（DP）等阶段的转录组数据。利用R语言中的WGCNA包构建共表达网络，并关联模块与生理阶段，筛选出目标模块。选择连接度最高的前30个枢纽基因进行功能富集分析，并通过String网站构建蛋白质互作网络（Protein-protein Interaction Neiwork,PPI Network），使用Cytoscape软件分析出前20个核心基因。比较枢纽基因与核心基因的交集，得出乳腺发育的关键基因：妊娠晚期为KIF20A、CDC6、CDK1等；泌乳高峰期为PTPRZ1、SLC6A11；泌乳后期为MRPS34、MRPS2；干奶期包括TIMP2、ANGPTL2等。本研究结果为奶山羊乳腺发育的分子机制揭示提供了基础。
关键词：奶山羊;;加权基因共表达网络分析;;乳腺发育;;基因调控
基金资助：陕西省自然基金重点项目（2022JZ-10）
