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作者：张凤;孙志文;上官爱哨;杨铭;赫海龙;张国庆;华再东;索效军;杨娟;耿宽;陈孟杰;易川奇;熊琪;
单位：湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室;中南民族大学生命科学学院;湖北省畜禽育种中心;河南省奶牛生产性能测定有限公司;
摘要：本研究旨在分析酰基辅酶A氧化酶1(Acyl-CoA oxidase 1, ACOX1)基因单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP）及其与生长育肥性状之间的关系，为肉牛育种提供新的标记资源。以240头夏洛来牛为研究对象，利用全基因组重测序方法检测ACOX1内部的SNP，并与生长育肥性状进行关联分析。结果表明：在夏洛来牛群体中共检测到ACOX1基因8个SNPs，关联分析结果显示，初生时期g.55672049A>G位点与体高性状显著关联；12月龄时g.55672049A>G和g.55676112A>G位点与体重或体斜长性状显著关联；断奶和6月龄时，8个SNPs位点均与生长性状中的一个或多个指标显著关联，提示可在断奶和6月龄时选择与目标性状相关的分子标记对夏洛来牛进行早期选择；g.55673438A>G、 g.55675384C>T、g.55676112A>G、g.55680392G>A、g.55681592A>G及g.55683268C>G 6个位点与背膘厚显著关联，且与生长性状间呈负相关。连锁不平衡结果显示，g.55672049A>G、g.55672909C>T、g.55673438A>G、g.55675384C>T、g.55676112A>G、g.55680392G>A及g.55681592A>G 7个SNPs构成1个单倍型模块，处于强连锁不平衡，GGAATAC为优势单倍型。以上结果表明，ACOX1基因可作为肉牛遗传改良的候选基因，8个SNPs可作为夏洛来牛品种持续选育的新分子标记。
关键词：肉牛;;ACOX1基因;;SNP;;生长性状;;背膘厚
基金资助：国家自然科学基金（32202649）;; 湖北省支持种业高质量发展资金项目（HBZY2023B008）;; 湖北省农业科技成果转化资金项目（2023BBB156）;; 武汉市知识创新专项基础研究项目（2023020201010140）;; 湖北省技术创新计划项目（2024BBB048）;; 湖北省中央引导地方科技发展专项（2023EGA108）
