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作者：吴志鹏;乔向东;才仁扎西;陈生梅;郭卫兴;周洛;普措来周;雷初朝;马志杰;
单位：青海大学畜牧兽医科学院;农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室;青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室;囊谦县畜牧兽医站;囊谦县农牧和水利局;西北农林科技大学动物科技学院;
摘要：囊谦青牦牛是我国拥有稀有毛色的牦牛群体，具有较高的经济、科研和旅游观赏等价值。然而，目前对其母系遗传多样性及群体遗传结构的研究仍相对有限。为进一步揭示囊谦青牦牛的母系遗传多样性、群体遗传结构及遗传背景，本研究利用高通量测序技术对44头囊谦青牦牛进行了基因组重测序，并提取了相应的线粒体基因组全序列，后对其线粒体基因组全序列遗传变异开展研究，探究其母系遗传多样性、群体遗传结构及遗传背景。结果表明：排除5处核苷酸插入/缺失后，44条囊谦青牦牛线粒体基因组全序列比对分析共检测到162处变异位点，包括37处单一多态位点和125处简约信息位点。根据核苷酸变异共确定了30种单倍型，单倍型多样度为0.973±0.012，核苷酸多样度为0.003±0.001。相较于已报道的野牦牛及中国22个家牦牛品种，囊谦青牦牛遗传多样性指数较高，表明其具有丰富的线粒体基因组母系遗传多样性。系统发育分析结果表明，囊谦青牦牛由Mt-I和Mt-II 2个线粒体基因组母系支系组成。综上所述，囊谦青牦牛线粒体基因组遗传变异丰富，母系遗传多样性水平较高，由2个母系支系组成，推测其拥有2个母系起源。
关键词：mtDNA基因组;;囊谦青牦牛;;遗传多样性;;群体结构
基金资助：青海省“昆仑英才·高端创新创业人才”计划（领军人才）项目;; 第三次全国畜禽遗传资源普查项目
