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中国畜牧杂志2025年第12期:滩羊KRT33B、KRT35和KRT39基因核心启动子鉴定及转录因子预测

来源:期刊VIP网 时间:


作者:李庆云;何海龙;李卓颖;曹凤凤;邢洲;施安;陶金忠;

单位:宁夏大学动物科技学院;

摘要:本研究旨在明确滩羊KRT33B、KRT35和KRT39基因的核心启动子区域并预测潜在的转录因子结合位点。试验构建KRT33B、KRT35和KRT39基因启动子区的双荧光素酶报告载体,转染细胞后确定核心启动子区域,使用在线软件PROMOHOMEPAGE预测KRT33B、KRT35和KRT39基因核心启动子区域的关键转录因子结合位点。KRT33B的核心启动子区域为-1 230~-330 bp,KRT35的核心启动子区域为-1 447~-800 bp,KRT39的核心启动子区域为-1 020~-33 bp。KRT33B基因核心启动子区域包含AP-1家族成员JUND、JUNB、C-JUN、C/EBP、转录抑制蛋白YY1,AP-2家族成员AP-2α的结合位点;KRT35基因核心启动子区域包含AP-1家族成员C-FOS、JUND、P300和转录抑制蛋白YY1的结合位点;KRT39基因核心启动子区域包含AP-1及其家族成员、JUNB、C-JUN、P300、C/EBP及其家族成员以及和转录抑制蛋白YY1的结合位点。综上,确定了KRT33B、KRT35和KRT39基因的启动子区分别位于基因序列的-1 230~-330 bp、-1 447~-800bp和-1 020~-33 bp区域。KRT33B、KRT35和KRT39基因核心启动子区域包含了与羊毛生长发育相关的AP-1转录因子结合位点,本研究为滩羊裘皮性状的研究提供了理论依据。

关键词:滩羊;;KRT33B;;KRT35;;KRT39;;转录因子

基金资助:国家自然科学基金(32460818)