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作者:钟姝凝;李佳宁;孙立斌;张园园;郑卫;张远东;
单位:吉林工商学院粮食学院;吉林省农特产品高值化利用与生物制造工程实验室;
摘要:戊糖乳植物杆菌(Lactiplantibacillus pentosus,L.pentosus)是能利用木质纤维素水解液发酵产乳酸的潜力菌株,具有一定的益生特性。为全面揭示一株戊糖乳植物杆菌的基因组结构、生物学特性、进化关系及益生功能,为生物质资源高效利用提供科学依据,采用Illumina NovaSeq与Pacbio Revio测序技术,结合生物信息学软件,全面解析所获菌株L.pentosus Lp-16的基因组,包括数据组装、优化、功能注释与预测,进一步通过基因共线性分析及构建分子进化树,深入探究L.pentosus Lp-16的生物学特性与进化关系。全基因组分析表明,L.pentosus Lp-16在碳水化合物代谢、氨基酸利用上高度富集,COG功能基因中碳水化合物运输和代谢基因最多(271个),KEGG功能注释中新陈代谢类最多(927个),预示其具有较强的环境适应和代谢能力。本研究揭示了L.pentosus Lp-16的全基因组信息,初步阐明了该菌株在细菌存活、宿主肠道定殖及抗菌活性等方面的具体作用,为开发益生菌候选菌株奠定理论基础。
关键词:戊糖乳植物杆菌;;生物信息学;;全基因组测序;;功能基因;;益生菌
基金资助:吉林省教育厅科学研究项目(JJKH20230260KJ);; 吉林省科技厅人才专项-青年成长科技计划项目(20220508060RC);; 吉林工商学院自然科学基金项目(YB2024[016]);; 吉林省大学生创新创业训练计划项目(202411261005)