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作者：薛倩;李国辉;张会永;殷建玫;周成浩;蒋一秀;韩威;
单位：江苏省家禽科学研究所;江苏省家禽科学研究所科技创新有限公司;
摘要：本研究旨在探索调控性连锁芦花鸡雏鸡头顶白斑大小的相关基因，为增加其识别度、提高雏鸡自别雌雄准确率提供科学依据。挑选性连锁芦花鸡雏鸡头顶白斑极大和极小个体各6只，采集其头顶白斑以下以及背部2处皮肤毛囊组织进行转录组测序，筛选差异表达基因（Differentially Expressed Genes,DEGs），对DEGs进行功能注释和富集分析以及蛋白互作网络构建；采用RT-qPCR技术对测序结果进行准确性验证。结果表明：大白斑组和小白斑组比较，分别在背部和头顶皮肤毛囊中筛选到18个和181个DEGs（|logFC|≥1,FDR<0.05）；背部DEGs中RET、DCX、ACVR1C 3个基因注释到神经嵴细胞分化和发育、细胞迁移和定位等生物过程；头顶DEGs中筛选到RPL17和GPR1322个细胞周期调控相关基因以及TUBA和FOS 2个细胞凋亡相关基因；头顶差异蛋白互作网络构建结果显示，网络中ZSWIM6、BTF3和SUB1 3个Hub基因均与细胞周期调控相关基因RPL17发生互作，并形成了子网络。RT-qPCR技术验证结果与RNA-Seq结果基本一致。推测以上系列基因可能在性连锁芦花鸡雏鸡头顶白斑大小形成过程中发挥重要作用。本研究结果为进一步深入探索性连锁芦花鸡雏鸡头顶白色斑块大小调控机制提供了参考。
关键词：性连锁芦花鸡;;雏鸡;;头顶白斑;;差异表达基因;;蛋白互作网络
基金资助：国家重点研发计划“农业生物种质资源挖掘与创新利用”重点专项资助（2021YFD1200803）;; 江苏省自然科学基金面上项目（BK20221285）;; 国家自然科学基金青年科学基金项目（32402749）;; 江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目（JBGS[2021]029）
