来源:期刊VIP网 时间:
作者:顾昊天;朱春红;陶志云;王志成;宋卫涛;耿明阳;刘宏祥;章双杰;徐文娟;王逸飞;李慧芳;
单位:江苏省家禽科学研究所;伊犁哈萨克自治州畜牧总站,伊犁哈萨克自治州畜牧科学研究所;
摘要:试验旨在对健康成年公鸭睾丸重量和精液量差异个体的下丘脑组织进行转录组测序和生物信息学分析,筛选出下丘脑在睾丸发育及精子发生过程中起关键调控作用的差异表达基因(Differentially expression genes,DEGs)及信号通路。选用230日龄健康金定公鸭40只,根据睾丸重量(XS vs XL)以及产精量高低(XF vsXM)分别采集下丘脑组织,每组随机挑选5个生物重复样本,并利用BGIseq平台进行转录组测序,对筛选到的DEGs进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of GenesandGenomes,KEGG)功能注释和富集分析,RT-qPCR验证挑选的DEGs表达水平。结果显示,XS vsXL和XFvsXM组共分析到1142个DEGs,不同分组间共同DEGs数为248个,RT-qPCR验证转录组测序结果准确可靠。GO和KEGG分析结果表明,DEGs显著富集于信号转导通路、胞外区、细胞质膜、质膜的整合成分、DNA结合、G蛋白偶联受体活性、神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、cAMP信号通路、Wnt信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、TGF-β信号通路、Hippo信号通路、ECM-受体相互作用等相关通路,GPR78、GRPR、GPR143、GPR119、GPR83、GH1、IGF1、PRL、LHX3、GATA3、MYB、RBPJL等基因显著富集其中。本研究鉴定出公鸭下丘脑调控睾丸发育及精子发生的关键候选基因,为优化水禽繁殖性能提供了理论依据。
关键词:鸭;;转录组测序;;下丘脑;;睾丸;;精液量
基金资助:国家重点研发计划(2022YFD1300100);; 江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目(JBGS(2021)[030]);; 扬州市自然科学基金(YZ2023167);; 扬州市现代农业项目(YZ2022050)