来源：期刊VIP网 时间：
作者：张虎;吴红雁;赵小芳;杜欣娜;
单位：江苏医药职业学院基础医学部生理生化教研室;江苏医药职业学院生物医药研究院;江苏医药职业学院基础医学部病理与病理生理学教研室;
摘要：目的 构建一种结直肠癌(CRC)免疫检查点抑制剂(ICI)治疗的预测标志物并验证。方法 首先利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)获得CRC免疫浸润相关基因模块。然后，利用单因素生存分析和Lasso-Cox回归构建CRC预后标签及其风险分数的计算公式，并利用Kaplan-Meier和受试者工作特征(ROC)曲线评估该标签预后效能。接下来，利用肿瘤免疫功能障碍和排斥(TIDE)在线工具评估各CRC数据集的免疫治疗效果，分析标签风险分数对上述治疗的预测作用。最后，基因集富集分析(GESA)被用于分析预后标签的潜在分子机制。结果 WGCNA筛选获得了免疫相关模块基因614个，其中63个基因与CRC预后有关(均P<0.05)。Lasso-Cox回归构建了一个包含17个基因的预后标签，低风险组CRC患者总体预后显著优于高风险组(P<0.001),且预后敏感度和特异度较高。进一步地，ICI治疗预测显示GSE39582中低风险组响应率显著高于高风险组(P<0.001),4个外部数据集验证结果均显示，低风险组ICI治疗响应率显著高于高风险组(P<0.001,P<0.05)。最后，GSEA显示G2M检查点、HEDGEHOG信号通路、干扰素反应、缺氧和上皮间质转化等信号通路可能介导预后标签调节免疫的功能。结论 基于免疫相关基因构建的预后模型不仅可以有效预测CRC患者总体生存率，还可以预测免疫治疗疗效。
关键词：结直肠癌(CRC);;加权基因共表达网络分析(WGCNA);;Lasso-Cox回归;;免疫检查点抑制剂(ICI)治疗
基金资助：国家自然科学基金面上项目(82274339);; 江苏省青蓝工程(2021);; 江苏省产学研合作项目(FZ20210156);; 江苏省教育厅科研项目(22KJD310001);; 盐城市工程中心(YC2022808);; 江苏医药职业学院校企横向合作项目(2021320906000215,2023320906000197);江苏医药职业学院校院横向合作项目(2021320906000004);江苏医药职业学院校级科研项目(20214401)
