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作者:王宗玉;陈闯;莫少丹;梁柳观;谢爱泽;邱华;郑景辉;
单位:广西中医药大学;广西医科大学附属肿瘤医院中医科;广西中医药大学附属瑞康医院;
摘要:目的 利用分子生物技术和网络分析冠心病痰瘀互结证的分子机制,预测可用于诊断和治疗冠心病痰瘀互结证的生物标志物及中药。方法 从SymMap数据库中检索和下载冠心病痰瘀互结证的相关中医证型和中医症状基因,从SymMap、DisGeNet、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)下载冠心病的疾病基因,取证型-症状基因和疾病基因交集获得冠心病的痰瘀互结证基因。使用DAVID数据库对冠心病痰瘀互结证基因分别进行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,并使用STRING数据库分别构建蛋白质互作(PPI)网络,通过Cytoscape分别筛选出核心基因,通过基因表达综合(GEO)基因数据集验证核心基因,导入Coremine Medical数据库映射出具有潜在治疗作用的中药。将冠心病痰瘀互结证基因的核心基因导入miRWalk数据库,获得与核心基因有关联的miRNAs,并运用FunRich软件对核心基因关联的miRNAs进行富集功能注释。结果 共筛选出208个冠心病痰瘀互结证基因,通过分析获得8个冠心病痰瘀互结证核心基因:连环蛋白β(CTNNB)1、转化生长因子(TGF)-β受体(TGFBR)2、原纤维蛋白(FBN)1、平滑肌肌动蛋白α(ACTA)2、TGF-β细胞因子超家族细胞内信号转导分子(SMAD)家族成员(SMAD)3、Ⅰ型胶原α1链(COL1A1)、赖氨酰氧化酶脂氧化酶(LOX)、Ⅲ型胶原α1链(COL3A1)。在GEO数据库的GSE61144数据集中,核心基因CTNNB1、TGFBR2在STEMI组中高表达,SMAD3在STEMI组中低表达,受试者工作特征(ROC)曲线提示CTNNB1、TGFBR2、SMAD3对于STEMI均有一定的诊断价值。核心基因预测的高频中药具有活血、利水祛湿、补气健脾、温里散寒、化痰消肿功效。通过miRWalk数据库,获取冠心病痰瘀互结证核心基因映射的miRNAs共40个,其中miR-124-3p为关键miRNA,与COL1A1和CTNNB1两个核心基因相互作用。结论 生物信息学分析可以从分子层面初步阐明论证中医证候理论,可预测关键生物标志物,为提高病证诊断、治疗量化、规范化标准、治疗相关疾病和开发中药新型药物提供借鉴和参考。
关键词:冠心病;;痰瘀互结证;;生物信息学;;中医证候;;中药;;miRNA
基金资助:国家中西医协同“旗舰”科室(国中医药综结合函[2024]221号);; 广西中医药大学“岐黄工程”高层次人才团队培育项目(2021005);; 黄智芬全国名老中医药专家传承工作室建设项目(桂中医药[2023]1号)