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中国老年学杂志2025年第24期:基于miRNA测序的特发性肺纤维化大鼠肺组织差异表达基因

来源:期刊VIP网 时间:


作者:赖春冰;周莹;刘锐;

单位:广西中医药大学研究生院;广西中医药大学附属瑞康医院;

摘要:目的 研究特发性肺纤维化(PF)大鼠肺组织差异表达显著miRNA及其靶基因,寻找调控特发性PF进程新的miRNA、mRNA。方法 30只SD大鼠随机分为空白组、模型组,造模后第14天取肺组织进行苏木素-伊红(HE)、Masson染色鉴定模型是否成功建立,随后进行miRNA测序。筛选差异表达显著miRNA,预测差异表达miRNA相关靶基因并进行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,建立互作网络。miRNA q PCR验证差异最为显著的3条miRNA表达、实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)验证关键mRNA表达。结果 气管内注射博来霉素第14天成功建立特发性PF大鼠模型; miRNA测序结果显示,空白组与模型组差异表达miRNA共9条,5条上调,4条下调,3条差异倍数表达miRNA;富集分析涉及蛋白质磷酸化、组织形态变化等生物过程,参与Apelin、鞘脂、转化生长因子(TGF)-β等信号通路; miRNA q PCR验证结果显示3个基因表达趋势与测序结果一致;与空白组比较,模型组Onecut2 mRNA显著高表达,YY1、Ddi2、Klf12 mRNA显著低表达(P<0.05,P<0.01)。结论 miR-181a-1-3p、miR-501-3p、miR-3570可能影响特发性PF关键miRNA,Onecut2、Klf12、YY1、Ddi2可能是其发挥作用的重要靶点,并可能通过Apelin、鞘脂、TGF-β信号通路调控特发性PF进程。

关键词:特发性肺纤维化;;miRNA测序;;生物信息学

基金资助:国家自然科学基金(82360911);; 第五批全国临床优秀人才研修项目(国中医药人教函[2022]1号);; 广西青年岐黄学者培养项目(桂中医药科教发[2022]13号);; 广西研究生教育创新计划项目(YCSW2022340)