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作者：裴兰英;吕慧慧;金锦;郑明常;
单位：河南中医药大学医学院;河南中医药大学第三附属医院;
摘要：目的 探讨骨骼肌衰老中自噬相关基因的表达，寻找骨骼肌衰老中的关键自噬基因，探索自噬相关基因对骨骼肌衰老早期诊断的意义。方法 采用基因表达综合数据库(GEO)数据库，以GSE8479为训练集，获取不同年龄人群骨骼肌中差异表达基因，从人类自噬数据库获得自噬相关基因，应用生物信息学方法寻找骨骼肌衰老中自噬相关差异表达基因(DEGs),应用蛋白质相互作用数据库(STRING)构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络，通过Cytoscape的Cytohubba和Mcode联合筛选中枢基因。以GSE59880和GSE47881作为验证集，采用SPSS23.0软件中独立样本t检验的方法对筛选出的基因进行验证，P≤0.05认为具有统计学意义，采用GraphPad Prism9.0进行图形绘制。结果 在GSE8479数据集中共筛选出3个自噬相关中枢基因[溶酶体相关膜蛋白(LAMP)1、自噬相关蛋白(ATG)12和叉头框蛋白(FOX)O3],在衰老骨骼肌组织中3个基因均出现上调，其中ATG12和FOXO3在GSE59880和GSE47881中均有统计学差异(P<0.05),利用两个基因进行联合诊断，联合诊断的曲线下面积(AUC)在两个数据集中分别为0.840和0.979。结论 自噬相关基因ATG12和FOXO3在衰老骨骼肌中同时出现过表达，可利用这一特征进行骨骼肌衰老的早期诊断。
关键词：生物信息学;;骨骼肌衰老;;自噬
基金资助：河南省中医药科学研究专项(2024ZY3093);; 河南中医药大学科研苗圃工程项目(MP2023-14)
