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作者：张斌;项羽羚;杨雪英;朱峰;谭立明;周斌;
单位：鹰潭市人民医院输血科;鹰潭市疾病预防控制中心检验科;鹰潭市人民医院检验科;南昌大学第二附属医院检验科;
摘要：目的 探究铁死亡基因表皮生长因子受体(EGFR)和周期依赖性激酶抑制剂(CDKN)1A对类风湿关节炎(RA)早期诊断价值及与疾病活动度的相关性。方法 从基因表达数据库(GEO)中筛选RA数据集GSE55235,并获得差异表达基因；与铁死亡相关基因作交集，得到交集基因。对交集基因作基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析，并利用蛋白互作用网络(PPI)分析得到铁死亡Hub基因。在训练集(GSE55235)和验证集(GSE93272)中验证Hub基因在RA中的诊断价值，选取154例早期RA患者(RA组)作为外部验证，并选择同期43例健康体检者为HC组。实时荧光定量-聚合酶链反应(qRT-PCR)检测Hub基因在早期RA中的表达。结果 共获得铁死亡交集基因43个，显著富集在铁死亡、缺氧诱导因子(HIF)-1信号和氧化途径等通路。PPI分析选择前3基因EGFR、前列腺素内过氧化物合酶(PTGS)2和CDKN1A作为铁死亡Hub基因。免疫浸润景观分析显示，RA患者中浆细胞和T细胞CD8显著高表达，而肥大细胞激活表达下降，且Hub基因和肥大细胞均存在正相关(P<0.05)。在外部验证中，EGFR诊断RA患者灵敏度为0.907,RA患者活动组EGFR mRNA表达水平显著低于HC组(P<0.01);CDKN1A诊断RA患者灵敏度为0.884,RA患者活动组CDKM1A mRNA表达水平明显低于HC组和缓解组(P<0.05,P<0.01)。结论 铁死亡基因EGFR和CDKN1A有助于RA患者的早期诊断及疾病活动度评估。
关键词：类风湿关节炎;;铁死亡;;表皮生长因子受体;;周期依赖性激酶抑制剂1A;;前列腺素内过氧化物合酶2
基金资助：江西省重点研发计划(S2019ZPYFB0760);; 鹰潭市科技计划项目(No.202423-29876)
