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中国老年学杂志2025年第12期:基于生物信息学技术探究肺腺癌中FAM83A基因表达水平及其临床价值

来源:期刊VIP网 时间:


作者:董雷;

单位:佳木斯市中心医院肿瘤外二科;

摘要:目的 利用生物信息学手段分析序列相似性为83的家族成员A基因(FAM83A)在肺腺癌中表达及其临床意义。方法 分别利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)数据库获取正常肺非癌组织与肺腺癌组织中FAM83A基因的mRNA和蛋白表达信息,比较FAM83A在肺非癌组织与肺腺癌组织及不同基本临床信息、临床病理参数和肿瘤相关通路改变肺腺癌组织的表达差异,并对患者进行生存分析。此外,利用人类蛋白质图谱数据库对FAM83A进行蛋白互作分析。结果 与正常肺组织比较,FAM83A mRNA和蛋白在肺腺癌组织中的表达水平显著上调(P<0.01);与正常肺组织比较,不同性别、年龄、是否有吸烟习惯肺腺癌组织中FAM83A mRNA表达水平显著上调(P<0.01),且吸烟、戒烟(<15年)和戒烟(>15年)肺腺癌组织中的FAM83A mRNA显著高于不吸烟肺腺癌组织(P<0.01);与正常肺组织比较,FAM83A蛋白在红细胞衍生核因子2样蛋白(NRF)-2和受体酪氨酸激酶(RTK)通路有、无改变的肺腺癌组织中均显著上调(P<0.01),且NRF-2和RTK通路有改变肺腺癌组织中FAM83A蛋白表达均显著高于无改变肺腺癌组织(P<0.05,P<0.01);生存分析显示,肺腺癌组织高表达FAM83A mRNA患者生存期明显低于中低表达患者(P<0.000 1),且男性和女性高表达FAM83A mRNA患者的生存期均显著低于中低表达患者(P<0.000 1);蛋白互作分析显示,FAM83A与多种肿瘤相关蛋白存在互作关系。结论 FAM83A mRNA和蛋白在肺腺癌组织中显著上调,其表达水平与患者临床信息、病理参数、肿瘤通路改变及生存期有关,且其可能通过与多种肿瘤相关蛋白互作参与肺腺癌的发生与进展。

关键词:肺腺癌;;序列相似性为83的家族成员A基因(FAM83A);;生物信息学