来源:期刊VIP网 时间:
作者:严诏琦;徐义峰;李可可;刘良徛;
单位:江西中医药大学研究生院;江西中医药大学附属医院呼吸与危重症医学科;
摘要:目的 通过单细胞测序和孟德尔随机化分析研究阿尔茨海默病(AD)的生物标志物。方法 从高通量基因表达数据库(GEO)下载的外周血单核细胞的单细胞测序数据中鉴定出AD与正常人群的差异表达基因(DGEs),其次,通过表达数量性状位点联盟(eQTLGen)获取DGEs相关的表达数量性状位点(eQTL),并用作暴露遗传工具变量,国际AD基因组学项目(IGAP)联盟的全基因组关联分析(GWAS)汇总数据用作AD的结局工具,两者进行双样本孟德尔随机化用以确定与AD具有遗传关联的核心基因,最后,运用pQTL数据集寻找核心基因的汇总统计以鉴定在基因及表达蛋白层面上均具有调控意义的生物标志物。结果 从656个DGEs中初步鉴定出了32个与AD存在因果关联的核心基因,包括了20个保护性基因、12个易感基因。其中LCP1的编码蛋白L-塑蛋白(plastin)与AD风险正相关(OR=1.32,95%CI=1.13~1.55;P=5.90×10~(-5)),且科克伦Q检验(Cochran Q)-P值=0.61,孟德尔随机化Egger截距检验(MR-Egger Intercept)-P值=0.75,孟德尔随机化多效性残差和与离群值检验(MR-PRESSO)-P值=0.07,表明不存在水平多效性和异质性。结论 高水平的淋巴细胞胞质蛋白(LCP)1及其编码蛋白L-plastin均与AD的发病风险具有强因果关联,是AD的危险生物标志物。
关键词:阿尔茨海默病;;淋巴细胞质蛋白(LCP)1;;L-塑蛋白(plastin);;孟德尔随机化分析;;单细胞测序
基金资助:国家自然科学基金项目(81860826);; 江西省自然科学基金项目(20192ACBL20023);; 江西中医药大学科创项目(CXTD22011)