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作者：刘洁;杨冰娜;全湛柔;邹红岩;
单位：深圳市血液中心输血医学研究所;
摘要：目的:对1例HLA-DRB1基因分型模棱两可结果进行分析确认。方法:采用Illumina MiSeq平台NGS技术对1例造血干细胞捐献者标本进行HLA基因分型，之后采用基于PacBio SMRT三代测序对该标本HLA-DRB1位点模棱两可结果进行序列分析和确认。结果:Illumina MiSeq的NGS分型结果显示，标本存在HLA-DRB1*11新等位基因(DRB1*11:NEW, 12:01),与最近的等位基因DRB1*11:01:01:03相比，第一外显子40位碱基G突变为A。但由于DRB1第1内含子太长，突变点离附近的杂合点都太远，没有reads能覆盖，无法确定突变点位于哪个基因，只是软件随机分配的结果。为确认分型结果，本研究采用PacBio长读长三代测序技术对该位点进行检测。结果显示，该样本DRB1分型结果为HLA-DRB1*11:01,12:10;即E1-40A实际位于HLA-DRB1*12:XX这条等位基因上，正好与HLA-DRB1*12:10完全匹配。结论:对于某些二代测序提示的新等位基因，尤其是离其他杂合点较远的模棱两可的情况，还需要通过第3种方法如三代长读长测序技术进行分析和确认，才能得到可信的结果。
关键词：HLA-DRB1等位基因;;二代测序;;三代测序
基金资助：国家自然科学基金青年科学基金项目(32301234);; 深圳市医学重点学科(SZXK070);; 深圳市医疗卫生三名工程项目(SZSM202311032)
