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作者:廖明玥;龙玲玉;焦瑶;赵鸣悦;闫楠;周亚兰;韩朝悦;杨阳;赵晓甦;常英军;黄晓军;阮国瑞;
单位:北京大学人民医院,北京大学血液病研究所,国家血液系统疾病临床医学研究中心,血液肿瘤细胞和基因治疗北京市重点实验室;北大-清华生命科学联合中心,前沿交叉学科研究院;
摘要:目的:研发一种新的基于TaqMan-MGB探针的实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)检测方法,用于急性髓系白血病(AML)和慢性中性粒细胞白血病(CNL)患者CSF3R~(T618I)突变的初筛和随访监测。方法:利用PrimerExpressv3.0软件设计特定的引物和探针,并根据野生型(CSF3R~(wt))和突变型(CSF3R~(T618I))基因组DNA序列构建质粒标准品,绘制标准曲线,用于定量检测CSF3R~(T618I)突变。DNA样本来源于421例AML患者和12例CNL患者。结果:成功建立了一种利用TaqMan-MGB探针定量检测CSF3R~(T618I)突变的方法。在野生型背景下,CSF3R~(T618I)突变的检测灵敏度可达0.625%。本研究队列中,AML患者的CSF3R~(T618I)突变检出率为3.33%(14/421),CNL患者的突变检出率为83.33%(10/12),与高深度靶区测序(TRS)和Sanger测序的结果高度一致。20名健康供者中均未检测到CSF3R~(T618I)突变。利用标准曲线计算突变阳性的CNL患者CSF3R~(T618I)等位基因突变频率平均值为(38.90±15.20)%,高于突变阳性AML患者的平均值[(21.72±16.11)%,P=0.015]。结论:基于TaqMan-MGB探针的qPCR是一种简便、灵敏的定量检测方法,可用于筛查CNL或AML患者中的CSF3R~(T618I)突变,有助于疾病的诊断以及治疗反应的监测。
关键词:急性髓系白血病;;慢性中性粒细胞白血病;;CSF3R~(T618I);;TaqMan-MGB探针;;qPCR
基金资助:国家自然科学基金(82570203);国家自然科学基金重点项目(82293630);; 国家重点研发计划(2022YFA1103300)