来源：期刊VIP网 时间：
作者：高素青;全湛柔;钟艳平;陈浩;何柳媚;邹红岩;邓志辉;
单位：深圳市血液中心输血医学研究所;
摘要：目的：研究二代测序技术（NGS）检测深圳地区随机健康无关汉族人群HLA-DRB1、DQB1、DQA1、DRB3、DRB4、DRB5、DPA1、DPB1等位基因多态性的精确性，探讨HLA-DRB1等位基因丢失的原因及室内关键质控体系建立策略。方法：采用Mi Seq DxTM NGS平台对1 012例样本完成HLA-II类等位基因分型。对质控体系软件提示的疑难样本和HLA-DRB1纯合子样本采用PCR-SSOP法或PCR-SBT法进行确认。结果：检出HLA-DRB1、DRB3、DRB4、DRB5、DQA1、DQB1、DPA1、DPB1等位基因分别有45、7、5、7、17、21、10、27种。常见等位基因（频率>10%）有HLA-DRB1*09:01(17.09%)、15:01(10.72%);DRB3*02:02(25.99%)、03:01(10.18%);DRB4*01:03(36.46%);DRB5*01:01(15.42%);DQA1*01:02(20.01%)、03:02(17.19%);DQB1*03:01(19.47%)、03:03(17.98%)、05:02(11.66%)、06:01(10.67%);DPA1*02:02(54.45%)、01:03(31.18%);DPB1*05:01(39.13%)、02:01(16.90%)。HLA-DRB1和DQB1位点基因频率与中国常见及确认的HLA等位基因表（CWD2.4）进行统计学比较,差异无统计学意义（χ2=12.68,P>0.05)。对NGS检出的94例HLA-DRB1纯合子样本采用PCR-SSOP法进行复检，检出HLA-DRB1位点漏检等位基因1例，通过SBT法确认为漏检DRB1*04:03等位基因，为此建立了本实验室室内质控体系。检出新等位基因2例，获WHO HLA系统因素命名委员会命名。结论：基于NGS-HLA分型方案的HLA分型结果，模棱两可结果比率更低。HLA-II类等位基因在深圳地区无关健康供者汉族人群中存在遗传多态性。在临床组织相容性试验中独立使用NGS方法存在局限性，需要内部质量控制策略来防范偶发的等位基因丢失事件。
关键词：人类白细胞抗原;;基因频率;;二代测序;;等位基因丢失
基金资助：深圳市科技计划项目（JCYJ20160425100217087）;; 深圳市医疗卫生三名工程项目（SZSM201811092）;; 深圳市医学重点学科（SZXK070）
