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作者：孙妍;杨二鹏;李雨蒙;牛继聪;赵霈;刘为易;陈卓;王明镜;范腾;胡晓梅;
单位：北京中医药大学研究生院;中国中医科学院西苑医院血液科;中山大学肿瘤防治中心综合中医科;
摘要：目的:基于转录组测序技术分析原发性血小板增多症(ET)血小板活化相关基因，寻找与ET血栓形成相关的潜在靶点。方法:收集ET患者和健康人的血液标本进行转录组测序，选取差异表达的lncRNA、miRNA和mRNA,构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。使用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对调控网络中的差异mRNA进行富集分析。应用实时荧光定量PCR (Real-time PCR)方法验证关键信号通路上的差异mRNA。结果:共鉴定出差异表达的32个lncRNA(3个上调、29个下调)、16个miRNA(8个上调、8个下调)和35个mRNA(27个上调、8个下调)。其中5个lncRNA、12个miRNA和19个mRNA构成调控网络。KEGG富集分析显示，差异mRNA与血小板活化信号通路相关，与血小板活化相关的差异mRNA有6个，分别为F2R、ITGA2B、ITGB1、ITGB3、PTGS1和GP1BB,均表达上调。RT-PCR验证结果显示，与健康人相比，ET患者5个mRNA包括F2R、ITGA2B、ITGB1、ITGB3和GP1BB表达水平上调，与转录组测序结果一致，而PTGS1表达无显著差异。结论:ET患者差异mRNA与血小板活化通路相关，F2R、ITGA2B、ITGB1、ITGB3和GP1BB mRNA可作为ET血小板活化相关的新靶点。
关键词：原发性血小板增多症;;转录组学;;lncRNA-miRNA-mRNA;;血小板活化
基金资助：国家自然科学基金面上项目(82174360);; 中国中医科学院科技创新工程重大攻关项目(CI2021A01702,CI2021A01707)
