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中国老年学杂志2025年第02期:基于生物信息学的趋化因子CXCL3在胃癌中的作用

来源:期刊VIP网 时间:


作者:杨晓帆;何坚;任红岳;张春斌;张辉;

单位:佳木斯大学基础医学院;漳州卫生职业学院基础医学院基础医学部科研平台;漳州卫生职业学院医学技术学院转化医学检测应用技术协同创新中心;

摘要:目的 基于生物信息学技术探讨CXC趋化因子配体(CXCL)3在胃癌中的表达水平、临床病理分期、预后、免疫浸润程度、富集分析、相关性分析及蛋白间相互作用。方法 应用UALCAN、基于基因表达水平值的交互式分析平台(GEPIA)数据库比较CXCL3在正常胃组织和胃癌组织中表达差异临床病理资料的意义。使用单因素生存曲线(Kaplan-Meier Plotter)网站分析CXCL3的表达对胃癌患者预后的影响。利用肿瘤免疫评估资源(TIMER)、基因组癌症分析(GSCA)数据库探索在胃癌中CXCL3的表达与免疫浸润的相关性。通过Linkedomics数据库了解在胃癌中与CXCL3表达密切相关的基因并进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。使用STRING网站得出CXCL3与胃癌的共同靶点基因的蛋白质相互作用网络。结果 与正常胃组织相比,CXCL3在胃癌中表达显著升高(P<0.000 1),且其高表达与患者年龄、种族、组织亚型等密切相关。CXCL3高表达患者在总生存期(P<0.000 1,HR=0.51)和无进展生存期(P<0.000 1,HR=0.55)的生存时间显著短于低表达的患者(均P<0.05)。免疫分析发现在胃癌中CXCL3与中性粒细胞、Th1等免疫细胞的浸润呈正相关(P<0.05)。富集分析显示,在胃癌中差异基因主要富集在白细胞介素(IL)-17信号通路和刺猬信号通路等。相关性分析显示,胃癌中CXCL3与CXCL1、CXCL2、IL-8的表达量显著正相关(P<0.05)。蛋白互作网络显示,与CXCL3在胃癌中产生相互作用的蛋白包括CXCL2、CXCL5、CXCR2等。结论 CXCL3在胃癌中高表达,其高表达与临床病理分期、患者生存时间、免疫细胞浸润程度具有一定关系,并且CXCL3可能通过与CXCL2、CXCR2等关键分子的相互作用参与胃癌的发生发展。

关键词:胃癌;;CXC趋化因子配体(CXCL)3;;生物信息学

基金资助:国家重点研发计划(2022YFC2009700);; 福建省自然科学基金(2023J01250);; 漳州市自然科学基金项目(ZZ2023J49);; 漳州卫生职业学院高层次人才科研启动经费项目(NO.BSKYQD-1)