来源：期刊VIP网 时间：
作者：胡永利;杜岩;刘天祥;达明绪;
单位：兰州大学第一医院(第一临床医学院);桂林医学院附属医院胃肠外科;兰州大学第二临床医学院;甘肃省人民医院肿瘤外科;
摘要：目的 探讨胃癌(GC)中上调的环状RNA(circRNAs)及其潜在生物学功能。方法 从基因表达综合数据库(GEO)下载微阵列数据进行分析，鉴定GC中差异表达的circRNAs。利用癌症基因组图谱(TCGA)数据集获得差异表达的miRNAs和mRNAs,通过癌症特异性circRNA数据库(CSCD)预测circRNAs与miRNAs之间的靶向关系。使用TCGA数据库筛选相关mRNAs和网络miRNAs,并通过microRNA靶点预测数据库(miRDB)与基于保守性分析的miRNA靶基因预测数据库(TargetScan)预测miRNAs与mRNAs之间的靶向关系，细胞图谱(Cytoscape)构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络，并进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析，探讨网络内的生物学过程。Kaplan-Meier曲线评估网络mRNAs的预后价值。结果 建立了包含4个circRNAs、8个miRNA和198个mRNAs的调控网络，这些mRNAs在细胞周期、磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、核质运输和p53信号通路等生物学功能中富集。4个mRNAs与总生存期显著相关。结论 4个差异表达的circRNAs可能在GC发病机制中发挥重要作用。
关键词：环状RNA;;胃癌;;基因表达综合数据库(GEO);;癌症基因组图谱(TCGA);;竞争性内源RNA(ceRNA)
基金资助：国家自然科学基金(82160588);; 桂林市科技计划项目(20220139-7-11);; 甘肃省人民医院硕士研究生导师培育项目(22GSSYB-8)
