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作者:刘洋;曹赛雅;冯月娇;王杰;陈腾;
单位:上海中医药大学附属普陀医院普外科;
摘要:目的 基于计算生物学构建一个与双硫死亡基因相关长链非编码RNA(LncRNA)的预后模型。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中收集胰腺癌病例的转录组数据及临床信息筛选出与双硫死亡基因共表达的LncRNA,并基于这些LncRNA构建预后模型。利用乘积极限法、受试者工作特征曲线、C指数一致性分析等方法进行生存分析、模型性能评估和模型验证,最后进行免疫逃逸及药物敏感性分析验证模型性能和临床应用价值。结果 成功构建了基于8个双硫死亡基因相关LncRNA[TDRKH反义链转录本(TDRKH-AS)1、LINC01431、LINC02535、小核RNA宿主基因(SNHG)25、AC010531.6、AC010719.1、AL359504.1、AL022328.4]的预后模型,该模型的预测性能经过验证具有较高的准确性,免疫逃逸和药物敏感性分析进一步提供了模型在临床应用中的可能价值。结论 胰腺癌中双硫死亡基因相关的LncRNA预后模型为胰腺癌早期诊断和治疗提供了新的可能性,该模型的建立对于胰腺癌的精准医疗具有重要意义,并为探讨其生物学机制提供理论依据。
关键词:胰腺癌;;双硫死亡基因;;长链非编码RNA;;预后模型;;生物信息学
基金资助:国家自然科学基金面上项目(81973625);; 国家科技部重点研发计划(2019YFC1316000);; 上海市普陀区卫生健康系统临床特色专病建设项目(2019tszb01);; 上海市中医医院第三届中医传承人才项目(2023zycc02)