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作者:郑万财;党斌;张迹;罗巧玉;冯作山;
单位:青海大学农林科学院青藏高原种质资源研究与利用实验室;青海省青藏高原农产品加工重点实验室;淮阴师范学院生命科学学院;青海师范大学生命科学学院;新疆农业大学食品科学与药学学院;
摘要:目的:基于转录组测序分析葡萄籽原花青素对HepG2细胞基因及相关功能的影响,明确原花青素处理HepG2细胞的关键基因及代谢通路。方法:通过转录组测序,筛选差异基因,基因功能注释和KEGG通路的富集分析,进行葡萄籽原花青素处理细胞后的转录组学研究。结果:葡萄籽花青素处理HepG2细胞后主要富集到的生物学过程为细胞过程、代谢过程、生物调控过程、免疫系统过程、繁殖调节、生长调节。细胞凋亡的12个关键差异基因与TNF、p53、MAPK、PI3K-Akt、NF-κB信号通路密切相关。结论:细胞凋亡与TNF信号通路、p53信号传导途径、PI3K/Akt信号通路、NF-κB信号通路、MAPK信号通路密切相关。
关键词:葡萄籽;;原花青素;;转录组测序;;HepG2细胞;;基因功能
基金资助:青海省科技厅创新平台建设项目(编号:2022-ZJ-T04);; 青海“昆仑英才·高端创新创业人才”计划特色人才项目(编号:2022-027)