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食品科技2024年第02期:解硫胺类芽孢杆菌SY20实时荧光定量PCR内参基因筛选

来源:期刊VIP网 时间:


作者:吴雅萍;杨技欣;刘冬梅;

单位:漳州职业技术学院食品工程学院;华南理工大学食品科学与工程学院;

摘要:为研究解硫胺类芽孢杆菌SY20产多黏菌素相关基因的表达水平,需使用合适的内参基因进行荧光定量聚合酶链式反应法(Polymerase chain reaction, PCR)校正才能获得可信的检测结果。以RecA、RpoB、ftsZ、GAPDH及16S rRNA基因为候选基因进行内参基因筛选,利用荧光定量PCR分析这5个候选基因在解硫胺类芽孢杆菌SY20不同发酵时期的表达情况,再利用GeNorm、Norm Finder、Best Keeper、比较Delta-Ct以及Ref Finder 5个软件综合分析评估了5个候选内参基因的表达稳定性。结果显示,GeNorm分析表明ftsZ和RecA基因表达较为稳定,而NormFinder、BestKeeper、比较Delta-Ct及RefFinder分析表明ftsZ基因更为稳定。因此,结合5种分析方法确定fts Z为最适合用于分析解硫胺类芽孢杆菌SY20基因表达的内参基因。

关键词:解硫胺类芽孢杆菌;;实时荧光定量PCR;;内参基因筛选

基金资助:广东省自然科学基金项目(2021A1515012451);; 漳州市食品产业技术研究院开放课题(ZSY2021114)