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食品科技2024年第04期:基于高通量测序分析石斑鱼冷藏期间的微生物菌群结构变化

来源:期刊VIP网 时间:


作者:黄丽;祁岑;蒋红明;陈德强;

单位:北部湾大学;广西高校北部湾海产品高值化利用与预制食品重点实验室;

摘要:为探究石斑鱼在4 ℃冷藏过程中微生物菌群结构的变化规律,实验采用Illumina高通量测序技术对冷藏0~9 d期间石斑鱼的细菌、古菌和真菌菌群多样性进行分析。Alpha多样性指数分析表明,在冷藏的各阶段鱼样中,各类微生物的菌群相对丰度与多样性由高至低依次为细菌>真菌>古菌。菌群结构分析表明,在石斑鱼冷藏期间各类微生物的主要优势菌群会发生一定演替,在冷藏过程中(第3~9天)相对丰度较为稳定的优势细菌菌群有Phenylobacterium、unclassified Clostridiales XIII、unclassified Ruminococcaceae和unclassified Clostridiales,优势古菌菌群有Methanothrix和Methanobacterium,优势真菌菌群有Issatchenkia、Rhizomucor、Cutaneotrichosporon和Disculoides。主成分分析表明,在鱼样冷藏期间(第3~9天)细菌菌群结构的差异变化小于古菌与真菌。对细菌组进行PICRUSt功能预测发现,在冷藏3 d后,与氨基酸代谢、信号转导、醇醛代谢、耐药转运、应答调控及离子转运相关的基因相对丰度明显上升。研究结果为进一步从微生物抑制机制上优化石斑鱼贮藏保鲜技术提供理论参考。

关键词:石斑鱼;;高通量测序;;菌群;;多样性

基金资助:广西科技计划项目(桂科AD19245119);; 北部湾大学引进高层次人才科研启动项目(2019KYQD11)