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作者：刘珊;蒋杨丹;颜佶沙;谢宇宣;赵思佳;何启田;赵甲元;
单位：西南土地资源评价与监测教育部重点实验室(四川师范大学);四川师范大学生命科学学院;浙江大学生物系统工程与食品工程学院;
摘要：目的：通过全基因组测序和生物信息学，研究前期筛选可降解高效氯氰菊酯（β-CY）蜡样芽孢杆菌GW-01的基因组序列信息和生物学特性，为其安全性评估提供参考。方法：利用HPLC验证了GW-01降解β-CY的能力。GW-01的整个基因组基于二代Illumina NovaSeq与三代PacBio Sequel测序平台相结合的测序技术，对菌株GW-01进行全基因组测序，并对测序数据进行基因组组装、基因预测与功能注释、碳水化合物活性酶预测、毒力因子和抗生素抗性分析，此外，还基于gyrA基因序列对菌株GW-01构建系统发育树。结果：GW-01在第6 d可降解48.4%的β-CY;GW-01菌株全基因组大小为5244145 bp，基因组类型为环状，平均GC含量36.43%，共编码5314个基因，含有104个tRNA基因，313个ncRNA,GW-01菌株全基因组序列在GO、KEGG、COG、NR和Swiss-Prot、CAZy、VFDB、CARD数据库分别注释到基因3536、4714、4434、5290、3854、135、263和96个，GW-01与其他四个近缘菌株相比显示出高GC含量，并且毒力因子和耐药基因较少。结论：GW-01与其近缘菌相比，显示出明显不同的进化途径和毒素编码基因，表明其安全性较高。
关键词：蜡样芽孢杆菌;;全基因组测序;;生物学特性;;安全性
基金资助：国家自然科学基金（31801644）;; 四川省科技厅面上项目（2022NSFSC0113）;; 固态发酵资源利用四川省重点实验室开放基金项目（2021GTYY01）
