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食品与发酵工业2024年第06期:实时荧光环介导等温扩增快速分型致泻大肠埃希氏菌方法的建立

来源:期刊VIP网 时间:


作者:李芮;黄艳梅;童晓钰;山珊;刘成伟;谭俣宬;陈芳;刘道峰;

单位:南昌大学公共卫生学院,江西省预防医学重点实验室;江西省疾病预防控制中心,江西省食源性疾病诊断溯源重点实验室,青年科研创新攻关团队;江西业力医疗器械有限公司;江西师范大学生命科学学院,国家淡水鱼加工技术研发专业中心;

摘要:致泻大肠埃希氏菌(diarrheagenic Escherichia coli, DEC)是一种重要的食源性致病菌,该研究立足DEC目前流行率高、基层分型困难的现状,建立了快速分型5种DEC的实时荧光环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)方法。针对DEC的8段特征性毒力基因pic、aggR、lt、st、stx1、stx2、escV、invE及大肠埃希氏菌属特异性基因uidA设计LAMP引物,优化反应体系,并对方法的分析性能及临床菌株分型效果进行了评价。结果显示,所建立的方法对pic和escV的检出限是1 ng/μL,对aggR、stx1、invE和uidA的检出限是100 pg/μL,对lt、st和stx2的检出限是10 pg/μL,该方法灵敏度与特异度均为100%,DEC型别间无交叉反应,对临床菌株的分型与实际结果完全一致。方法快速简便、设备要求低,借助恒温荧光读取设备可在40 min内迅速判定待检菌株是否为DEC及其致病类型,可满足各机构现场快速检测的需求。

关键词:致泻大肠埃希氏菌;;实时荧光环介导等温扩增;;快速检测;;毒力基因;;分型;;食品安全

基金资助:国家自然科学基金(82003467);; 江西省重点研发计划(20192BBGL70053,20192BBG70069);; 江西省自然科学基金面上项目(2020BAB206066);; 江西省卫健委科技计划(202130977);; 江西省高层次高技能领军人才培养工程(2021年度)