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食品与发酵工业2024年第12期:副溶血性弧菌不耐热溶血素的生物信息学分析与分子动力学模拟

来源:期刊VIP网 时间:


作者:张德福;于振兴;张明;吕欣然;张永勤;张国清;励建荣;

单位:渤海大学食品科学与工程学院,渤海大学海洋研究院,生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心;山东美佳集团有限公司;锦州市农业农村综合服务中心水产技术推广站;

摘要:副溶血性弧菌是一种革兰氏阴性人畜共患致病菌,可引发人类胃肠炎等食源性疾病。副溶血性弧菌具有多种毒力因子,热不稳定溶血素(thermolabile hemolysin, TLH)即是其中之一。该研究对副溶血性弧菌的tlh基因进行了克隆及测序,对tlh基因编码的TLH蛋白进行了生物信息学分析及结构和功能预测。结果表明,TLH蛋白由418个氨基酸组成,预测分子质量为47.36 kDa。在TLH蛋白中确定了几个保守的结构域和基序,包括SGNH水解酶结构域和GDSL基序;对TLH蛋白的三维结构进行了同源建模及验证,在此基础上通过分子动力学模拟分析其稳定性、与4-硝基苯基月桂酸酯(p-nitrophenylaurate, PNPL)的相互作用能力及结合底物对结构紧密度和残基灵活性的影响,揭示了催化三联体Ser153-His390-Asp393周边是一个重要的药物靶点活性口袋,具有高度保守的残基序列,并在底物结合后表现出残基灵活性差异。该研究分析了副溶血性弧菌TLH蛋白的性质和结构,可以为保障水产品的安全性、提高水产品原料安全评价水平提供理论支持。

关键词:基因克隆;;副溶血性弧菌;;不耐热溶血素(tlh);;生物信息学分析;;分子动力学模拟

基金资助:渤海大学海洋研究院开放课题(BDHYYJY2024003);渤海大学食品科学与工程学院预研项目