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食品与发酵工业2024年第20期:凝结芽胞杆菌(Bacillus coagulans)分类变迁与鉴定

来源:期刊VIP网 时间:


作者:曹艳花;冯会粉;唐腾飞;刘蕊;辛迪;程坤;姚粟;

单位:中国食品发酵工业研究院有限公司,中国工业微生物菌种保藏管理中心;

摘要:研究凝结芽胞杆菌(Bacillus coagulans)的分类学变迁,凝结芽胞杆菌(Bacillus coagulans)曾重新分类为凝结魏茨曼氏菌(Weizmannia coagulans),当前分类正确名称为凝结海恩德里克斯氏菌(Heyndrickxia coagulans)。该研究通过基于全基因组的分类,除了重新复核菌株CICC 20138的16S rRNA基因序列分析外,还包括核心基因组多位点序列分型(core genome multilocus sequence typing, cgMLST)、平均核苷酸一致性(average nucleotide identity, ANI)以及数字DNA-DNA杂交(digital DNA-DNA hybridization, dDDH)的种水平分析。通过形态学和生理生化特征分析获得CICC 20138的表型信息。依据16S rRNA基因序列相似性分析,CICC 20138与H.coagulans和H.faecalis的相似性最高,均为99.20%。菌株CICC 20138(GCA_009936615.1)基因组大小为3 386 433 bp,含有216个contigs,基因组DNA G+C含量为46.7 mol%。cgMLST分析结果显示,菌株CICC 20138与H.coagulans以100%支持率聚在同一分支,亲缘关系最近。ANI分析显示,CICC 20138与H.coagulans ATCC 7050~T(GCA_000832905.1)的ANI值为98.16%,dDDH值为87.1%,可将CICC 20138鉴定为H.coagulans。基于全基因组序列的ANI和dDDH分析是准确有效的菌种鉴定方法,从而得到更精准的物种分类信息。对于具有潜在重要价值的菌种,全基因组序列分析是了解微生物在分类和鉴定过程中进化的重要工具。

关键词:凝结芽胞杆菌;;凝结魏茨曼氏菌;;凝结海恩德里克斯氏菌;;分类变迁;;鉴定

基金资助:国家科技资源共享服务平台-国家菌种资源库项目(NMRC-2023-4)